Aplicaciones comerciales de la AHAS
Herbicidas inhibidores de la AHAS
Aparte de su importancia para la producción de aminoácidos ramificados, la AHAS es una diana clásica para compuestos comerciales herbicidas. Cinco clases principales de herbicidas que titnen a la AHAS como diana se comercializan en varios países alrededor del mundo: sulfonilaminocarboniltriazolinonas, triazolopirimidinas, ácidos pririmidinilsalicilicos, sulfonilureas y imidazolinonas. La interacción de las sulfonilaminocarboniltriazolinonas con la AHAS a nivel molecular todavía no ha sido estudiada. Los herbicidas inhibidores de la AHAS más populares comercializados actualmente son las sulfonilureas y las imidazolinonas ya que son altamente selectivos, potentes y no tóxicos para los animales. Una de las características más atractivas de las sulfonilureas y las imidazolinonas, es que debido al metabolismo diferencial que sufren en las distintas especies, es posible identificar compuestos que solo determinadas especies de cultivo son capaces de detoxificar. La detoxificación de estos herbicidas en las plantas se puede lograr a través de desalquilaciones, hidroxilación de los anillos, glucoconjugación o rotura de los anillos. Alternativamente, en vez de seleccionar el herbicida que sea detoxoficado específicamente por el cultivo, se ha vuelto popular generar variedades de cultivo resistentes a los herbicidas.
Triazolopirimidinas
Las triazolopirimidinas fueron inventadas a finales de los 80 por Dow Elenco. Las triazolopirimidinas consisten en un anillo aromático di o trisustituido unido por un corto puente a un sistema cíclico de triazolopirimidina. Dos de los grupos del primer anillo (R1 y R2) suelen ser grupos electrofílicos, como Cl o F. Un grupo del anillo de triazolopirimidina (R4) suele ser un grupo apolar como un H, un grupo metoxi o un grupo etoxi. Los otros grupos de la estructura pueden ser grupos tanto polares, como F, como apolares, como grupos metoxi. El anillo aromático puede ser sustituido por un anillo de quinolina, sinque la molécula pierda su capacidad de inhibir a la AHAS.
Ácidos pirimidinilsalicílicos
Los ácidos pirimidinisalicílicos fueron desarrollados a final de los 80. La estructura general de esta clase de herbicida consiste en un anillo de pirimidina disustituido unido ya sea por un átomo de azufre (ácido pirimidiniltiobenzoico) o por un átomo de oxígeno (ácido pirimidiniloxibenzoico) a un anillo sustituido de benzeno. Los grupos unidos al anillo de pirimidina (R3 y R4) suelen ser grupos metoxi, mientras que de los grupos unidos al anillo de benzeno, uno suele ser un grupo carboxil (R2), mientras que el otro (R1) varía desde un átomo de cloro hasta un gran anillo aromático. La inhibición de la AHAS vegetal por los ácidos pirimidinilsalicílicos es potente y no competitiva respecto al piruvato.
Las sulfonilureas fueron desarrollados al final de los 70 por el Dr. George Levitt. En 1984, después de dos años de la introducción al mercado de la primera sulfonilurea, se determinó que la AHAS era el sitio de acción de la sulfonilurea. Aunque la estructura de las sulfonilureas puede variar considerblemente, la mayoría consisten en un anillo aromático sustituido (R1) unido a, o bien una triazina disustituida, o bien a un anillo de pirimidina a través de un puente de sulfonilurea. El sustituyente del anillo aromático (R1) varía desde ésteres de metil o etil carboxil hasta grupos muchos más grandes como el trifluoropropano, aunque una de las sulfonilureas más potentes solo tiene un átomo de cloro como sustituyente en el anillo aromático. Normalmente, el puente de sulfonilurea no está sustituido en la posición R2. Sin embargo, una ligera elongación del puente por la adición de un grupo metileno o por un átomo de oxígeno adyacentes al grupo sulfonil puede ser tolerada. El heterociclo está normalmente disustituido (R3 y R4) con grupos más pequeños como grupos metoxi o metil. Las sulfonilureas inhiben a la AHAS de manera independiente respecto al tiempo. Se ha descrito que las sulfonilureas son inhibidores mixtos, no competitivos o algo competitivos con respecto al piruvato.
Las imidazolinonas fueron desarrollados a principios de los 80 por el Dr. Marinus Los. Las estructuras de las imidazolinonas son mucho menos variables que las de las sulfonilureas. En general, la mayoría de las imidazolinonas consisten en un anillo de piridina carboxilado, el cual puede no estar sustituido, estar (mono)sustituido o estar disustituido (R1, R2). El anillo de piridina puede ser reemplazado por un anillo de benzeno o un anillo de quinolina. Aunque tanto la configuración S como la R son activas, la configuración R es 10 veces más efectiva. Las imidazolinonas inhiben a la AHAS de manera independiente respecto al tiempo. Se ha descrito que las imidazolinonas son inhibidores mixtos o no competitivos con respecto al piruvato. Estos herbicidas son menos potentes que las sulfonilureas.
Sulfonilureas
Las sulfonilureas fueron desarrollados al final de los 70 por el Dr. George Levitt. En 1984, después de dos años de la introducción al mercado de la primera sulfonilurea, se determinó que la AHAS era el sitio de acción de la sulfonilurea. Aunque la estructura de las sulfonilureas puede variar considerblemente, la mayoría consisten en un anillo aromático sustituido (R1) unido a, o bien una triazina disustituida, o bien a un anillo de pirimidina a través de un puente de sulfonilurea. El sustituyente del anillo aromático (R1) varía desde ésteres de metil o etil carboxil hasta grupos muchos más grandes como el trifluoropropano, aunque una de las sulfonilureas más potentes solo tiene un átomo de cloro como sustituyente en el anillo aromático. Normalmente, el puente de sulfonilurea no está sustituido en la posición R2. Sin embargo, una ligera elongación del puente por la adición de un grupo metileno o por un átomo de oxígeno adyacentes al grupo sulfonil puede ser tolerada. El heterociclo está normalmente disustituido (R3 y R4) con grupos más pequeños como grupos metoxi o metil. Las sulfonilureas inhiben a la AHAS de manera independiente respecto al tiempo. Se ha descrito que las sulfonilureas son inhibidores mixtos, no competitivos o algo competitivos con respecto al piruvato.
Imidazolinonas
Las imidazolinonas fueron desarrollados a principios de los 80 por el Dr. Marinus Los. Las estructuras de las imidazolinonas son mucho menos variables que las de las sulfonilureas. En general, la mayoría de las imidazolinonas consisten en un anillo de piridina carboxilado, el cual puede no estar sustituido, estar (mono)sustituido o estar disustituido (R1, R2). El anillo de piridina puede ser reemplazado por un anillo de benzeno o un anillo de quinolina. Aunque tanto la configuración S como la R son activas, la configuración R es 10 veces más efectiva. Las imidazolinonas inhiben a la AHAS de manera independiente respecto al tiempo. Se ha descrito que las imidazolinonas son inhibidores mixtos o no competitivos con respecto al piruvato. Estos herbicidas son menos potentes que las sulfonilureas.
Sitio de unión a herbicidas de la AHAS
Las estructuras cristalinas de AHAS en asociación con sulfonilureas e imidazolinonas muestran que ambos tipos de herbicidas se unen a la proteína en un túnel que conduce al sitio activo, de modo que su unión bloquea el acceso del sustrato.
Unión de las sulfonilureas
La constelación de residuos aminoacídicos que forman el sitio de unión para la sulfonilurea es casi idéntica para la AHAS vegetal y para la de levaduras. La sulfonilurea se encuentra en una conformación en la que el anillo aromático presenta una rotación que lo aleja del eje del puente de sulfonilurea de modo que los sustituyentes voluminosos del anillo se alinean de forma paralela con los átomos del puente de sulfonilurea. Con unas pocas excepciones, la mayoría de residuos (Val196, Pro197, Met200, Ala205 y Asp376 en la AHAS vegetal) involucrados en el anclaje del anillo aromático de las sulfonilurea realizan los mismos contactos en la AHAS vegetal y en la AHAS de levadura. En contraste, las interacciones de la Gly121, Phe206, Lys256, Met351, Met570 y Val571 son bastante variables dependiendo de la AHAS y la sulfonilurea asociada. Respecto a estos últimos, excepto la Lys256 que puede presentar un puente de hidrógeno con el átomo de nitrógeno o el de oxígeno del puente de sulfonilurea, los demás residuos se asocian a la sulfonilura por interacciones hidrofóbicas con los sustituyentes de los anillos. La única diferencia sustancial entre la AHAS de levadura y la AHAS de plantas es que la Ser653 se encuentra cercana a la sulfonilurea en A. thaliana formando un puente de hidrógeno con el puente de hidrógeno, mientras que el residuo equivalente en S. cerevisiae, Gly657, se encuentra fuera del sitio de unión al herbicida.
Dos de los residuos más importantes que se unen a las sulfonilureas son Trp574 y Arg377, los cuales juegan un papel fundamental en la catálisis. Se cree que el Trp574 está involucrado en el reconocimiento del segundo sustrato. Se cree que la Arg377 es responsable del reconocimiento de sustrato por la unión al grupo carboxilo de los cetoácidos. Los nitrógenos terminales de esta arginina siempre forman puentes de hidrógeno con uno o más de los átomos de oxígeno del grupo sulfonil, uno de los átomos de nitrógeno del anillo heterocíclico, y si está presente, con el átomo de oxígeno del grupo metoxi del anillo heterocíclico.
Unión de las imidazolinonas
La molécula de imidazolinona se une dentro del canal que conduce al sitio activo en la configuración R y posicionada de forma que el anillo de dihidroimidazolona se dirige directamente a la tiamina difosfato, mientras que el anillo de quinolina sale hacia la superficie de la proteína. Solo el anillo de dihidroimidazolona y parte del anillo de quinolina de la imidazolinona comparten parte del sitiositio de unión de la sulfonilurea. De los 10 residuos involucrados en la unión de la imidazolinona a la proteína, 8 también están involucrados en la unión de las sulfonilureas. Por tanto, es imposible que ambos herbicids se unan e inhiban a la AHAS al mismo tiempo.
La imidazolinona se mantiene en el sitio de unión por 18 interacciones hidrofóbicas y por un puente salino entre el ácido carboxílico sustituyente y uno de los átomos de nitrógeno terminales de la Arg377. El anillo de quinolina se mantiene sujeto por los residuos Met200, Asp376, Arg377. Ser653, y Gly654. Ya que el anillo de quinolina no está presente en todas la imidazolinonas, estas conexiones pueden explicar las diferencias de la potencia de la inhibición entre distintas imidazolinonas. El anillo de dihidroimidazolona interacciona con las Lys256 y Trp574, mientras que los sustituyentes metil e isopropil, requeridos para una alta actividad herbicida, interaccionan con los carbono alfa de Ala122 y con las cadenas laterales de Ala122, Phe206, Gln207, Lys256 y Trp574. Aunque la sustitución del oxígeno exocíclico del anillo dihidroimidazolona es absolutamente necesaria para la actividad herbicida, no realiza ningún contacto con la AHAS.
Mecanismo de inhibición
El mecanismo de acción de los herbicidas no se conoce completamente. La mayoría de los estudios han sugerido que estos herbicidas se unen fuertemente a la enzima después de la formación del intermediario L-ThDP, lo que implica que la inhibición requiere condiciones para que se pueda llevar a cabo la catálisis. Este descubrimiento es consistente con la hipótesis de que el herbicida ocupa el lugar al que el segundo sustrato se une. Sin embargo, a partir de las estructuras cristalinas y diversos estudios, se ha demostrado que las sulfonilureas son capaces de unirse a AHAS e inactivarla en ausencia de sustrato. En un estudio se observó que la tiamina difosfato es absolutamente necesaria para la inhibición por una sulfonilurea de la AHAS II de E. coli. A partir de estas observaciones se sugirió que la inactivación enzimática podría corresponderse a un cambio en la conformación enzimática que desfavorecería la conformación en V de la tiamina difosfato, necesaria para la catálisis.
Además, se sugirió que las diferencia de afinidad entre las AHAS de distintas especies eran la causa de la incompatibilidad entre diversos estudios sobre la irreversibilidad de la inhibición por herbicidas. De hecho, en estudios en los que se verificó la eliminación del inhibidor, se observó que la AHAS bacteriana recuperaba su actividad, mientras que la AHAS de la cebada, la cual tiene una afinidad mucho mayor por la tiamina difosfato, no la recuperaba. Estudios recientes en la AHAS II de E. coli y en la AHAS de levadura han mostrado que durante el curso de la catálisis la tiamina difosfato es lentamente degradada. Además, en la presencia de sulfonilureas este proceso se acelera de algún modo. La mayoría de las estructuras cristalinas de AHAS asociadas con sulfonilureas muestran la tiamina difosfato fragmentada. Aunque en la estructura de la AHAS asociada a imidazolinona presenta la tiamina difosfato con su completa estructura, este ligando está deformado de forma similar a lo que ocurre con las sulfonilureas. Una consecuencia del cambio de conformación de la tiamina difosfato es una perturbación de la geometría de coordinación del ión de magnesio que mantiene anclada a la tiamina difosfato.
Otros inhibidores de la AHAS
Existen otros inhibidores sintéticos y naturales de la AHAS que no son comercializados como herbicidas debido a distintas causas, como ineficiencia debido a una baja absorción por la planta o a una alta tasa de detoxificación. Otra causa es que pueden ser que estos inhibidores también sean tóxicos para animales. Por ejemplo, el acetilfosfinato inhibe la piruvato deshidrogenasa además de la AHAS. Hasta hace unos pocos años, no ha existido mucho interés en desarrollar inhibidores de la AHAS para su uso como agentes antimicrobianos, ya que estos serían capaces de sobrevivir tomando los aminoácidos ramificados del medio.
No obstante, las micobacterias son buenas dianas para la inhibición de la síntesis de los aminoácidos ya que al replicarse dentro de fagocitos como los macrófagos, la disponibilidad de ciertos aminoácidos puede ser limitada. En 1998 se demostró que ciertas sulfonilureas seleccionadas eran efectivas para inhibir el crecimiento de varias cepas de M. tuberculosis. Las imidazolinonas muestran muy poca actividad o ninguna contra estas bacterias. Aunque la inhibición de estas cepas por sulfonilureas es mucho menos intensa que la llevada a cabo con los compuestos usados actualmente para tratar la enfermedad, su uso puede ser útil para controlar la expansión de esta enfermedad en lugares donde ha desarrollado resistencia a los medicamentos utilizados.
Referencias
McCourt J.A. and Duggleby R.G. (2006) Acetohydroxyacid synthase and its role in the biosynthetic pathway for branched-chain amino acids. Amino Acids. 31:173-210